R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

2024-02-26 1345阅读

温馨提示:这篇文章已超过388天没有更新,请注意相关的内容是否还可用!

在既往文章中,我们对孟德尔随机化研究做了一个简单的介绍。我们可以发现,使用TwoSampleMR包做出来的森林图并不是很美观。今天我们使用R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图。

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

使用TwoSampleMR包做出来的森林图是这样的

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

而很多SCI文章中的森林图是这样的

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

我们今天来做个上图这样的森林图,使用的是《R语言复现一篇6分的孟德尔随机化文章》的数据,这篇文章作者直接提供了数据,所以我就直接拿来用了。作者分析了很多精神病和骨密度的结果,这里我就取精神分裂症和骨密度结果来分析

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

我们构造森林图的大概格式如下,所以我们要按下图构造数据表格

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

这一步只能手工做,没什么好办法,不过也没花几分钟,样本量可以在网站上找,做好大概就是下图这样。公众号回复:孟德尔森林图,可以获得这个数据。

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

咱们先来导入数据看一下

R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

这样的格式和我们绘图格式还有点差别。我们还需调整一下,还有个问题就是95%CI这里的上线区间和下限区间是连在一起的,我们要把它分开提取出来,需要用到一点点非常简单的正则式小知识。使用正则式需要使用stringr包,我们先把95%ci单独提出来

library(stringr)
cl
VPS购买请点击我

免责声明:我们致力于保护作者版权,注重分享,被刊用文章因无法核实真实出处,未能及时与作者取得联系,或有版权异议的,请联系管理员,我们会立即处理! 部分文章是来自自研大数据AI进行生成,内容摘自(百度百科,百度知道,头条百科,中国民法典,刑法,牛津词典,新华词典,汉语词典,国家院校,科普平台)等数据,内容仅供学习参考,不准确地方联系删除处理! 图片声明:本站部分配图来自人工智能系统AI生成,觅知网授权图片,PxHere摄影无版权图库和百度,360,搜狗等多加搜索引擎自动关键词搜索配图,如有侵权的图片,请第一时间联系我们,邮箱:ciyunidc@ciyunshuju.com。本站只作为美观性配图使用,无任何非法侵犯第三方意图,一切解释权归图片著作权方,本站不承担任何责任。如有恶意碰瓷者,必当奉陪到底严惩不贷!

目录[+]